Se trata de un vecindario dependiente de L'Escala, conservado como pueblo medieval. Tiempo atrás había sido una península y acogió a los primeros habitantes a partir del siglo IX a. Tres siglos después, estableció relaciones comerciales con fenicios, púnicos y foceos masaliotas, que fue el inicio de las negociaciones que hicieron de Empúries uno de los puertos más importantes del Mediterráneo Desde entonces, Sant Martí de Empúries ha estado siempre habitado de forma continuada.

Hasta 1064, Sant Martí fue sede del condado de Empúries. Se conserva buena parte de la muralla medieval. La iglesia de Sant Martí se construyó en 1538, sobre el templo prerrománico del año 926. En contraste con el carácter medieval de la villa, en Sant Martí encontramos la Casa Forestal, de estilo modernista, actualmente sede de la fundación Iberia Graeca. Justo enfrente están los restos del antiguo castillo, que inspiró a Victor Mora, creador del cómic Capitán Trueno, por ser la sede del hogar del héroe.

Vale la pena recorrer las calles estrechas de Sant Martí. En la plaza Mayor encontramos varios restaurantes que ofrecen interesantes propuestas gastronómicas. Una vez visitado este núcleo, también es muy recomendable recorrer el paseo de Empúries, que une Sant Martí con el núcleo urbano de L'Escala. Son un par de kilómetros que permite descubrir las playas de Empúries, pasar justo al lado del yacimiento grecorromano de Empúries y ver el antiguo Moll Grec.